Ligasi DNA

Hitung massa tepat DNA sisipan yang diperlukan untuk rasio molar tertentu dengan vektor Anda.

Parameter Reaksi

Massa Vektor

Unit

Panjang Vektor

Unit

Masukkan Panjang

Unit

Rasio Molar (Masukkan:Vektor)

Sisipan yang Diperlukan

50.00ng

Diperlukan Masukkan Massa

Ratio3:1I:V

Total DNA100.0ng

Rasio vs. Sisipkan Massa

Overview

Ligasi menggabungkan dua fragmen DNA: vektor (tulang punggung) dan sisipan (gen yang diinginkan). Menyeimbangkan jumlah molekul DNA (rasio molar) sangatlah penting; terlalu banyak sisipan dapat menyebabkan concatemer, sedangkan terlalu sedikit akan mengurangi kemungkinan benturan antara ujung-ujung yang kompatibel.

💡

Pro Tips

Rasio 3:1 (Sisipkan:Vektor) adalah titik awal standar untuk sebagian besar ligasi ujung lengket.
Ligasi ujung tumpul sering kali mendapat manfaat dari rasio yang lebih tinggi (misalnya 5:1 atau 10:1) dan waktu inkubasi yang lebih lama.
Ujung lengket (ujung kohesif) mempunyai basa menjorok yang memberikan kekhususan dan stabilitas selama reaksi.
Pastikan DNA berkualitas tinggi; garam atau etanol dari peralatan pemurnian dapat menghambat T4 DNA Ligase.
Selalu sertakan kontrol 'Vektor Saja' (dengan ligase) untuk memeriksa latar belakang self-ligation.

Fun Facts

"T4 DNA Ligase berasal dari bakteriofag T4 dan membutuhkan ATP sebagai kofaktor."
"DNA Ligase ditemukan pada tahun 1967 oleh beberapa laboratorium hampir bersamaan."
"Di dalam tubuh Anda, ligase DNA terus-menerus bekerja memperbaiki kerusakan untai tunggal dalam genom Anda."
"Gibson Assembly dan Golden Gate Cloning adalah alternatif modern yang menggunakan enzim berbeda untuk mencapai ligasi yang mulus."

Formula: Sisipkan Massa = (Massa Vektor × [Masukkan Ukuran / Ukuran Vektor]) × Rasio

Used with this

Similar tools that might be useful

Hektar Per Jam

Hitung kecepatan kerja lapangan dan kapasitas peralatan pertanian.

Frekuensi Alel

Hitung frekuensi alel dan genotipe dalam suatu populasi menggunakan model keseimbangan Hardy-Weinberg.

Kalkulator Kehamilan Alpaca

Perkirakan tanggal lahir (tanggal lahir) alpaka Anda dan lacak kemajuan kehamilan.

Ligasi DNA

Hitung massa tepat DNA sisipan yang diperlukan untuk rasio molar tertentu dengan vektor Anda.

Parameter Reaksi

Massa Vektor

Unit

Panjang Vektor

Unit

Masukkan Panjang

Unit

Rasio Molar (Masukkan:Vektor)

Sisipan yang Diperlukan

50.00ng

Diperlukan Masukkan Massa

Ratio3:1I:V

Total DNA100.0ng

Rasio vs. Sisipkan Massa

Overview

💡

Pro Tips

Rasio 3:1 (Sisipkan:Vektor) adalah titik awal standar untuk sebagian besar ligasi ujung lengket.
Ligasi ujung tumpul sering kali mendapat manfaat dari rasio yang lebih tinggi (misalnya 5:1 atau 10:1) dan waktu inkubasi yang lebih lama.
Ujung lengket (ujung kohesif) mempunyai basa menjorok yang memberikan kekhususan dan stabilitas selama reaksi.
Pastikan DNA berkualitas tinggi; garam atau etanol dari peralatan pemurnian dapat menghambat T4 DNA Ligase.
Selalu sertakan kontrol 'Vektor Saja' (dengan ligase) untuk memeriksa latar belakang self-ligation.

Fun Facts

"T4 DNA Ligase berasal dari bakteriofag T4 dan membutuhkan ATP sebagai kofaktor."
"DNA Ligase ditemukan pada tahun 1967 oleh beberapa laboratorium hampir bersamaan."
"Di dalam tubuh Anda, ligase DNA terus-menerus bekerja memperbaiki kerusakan untai tunggal dalam genom Anda."
"Gibson Assembly dan Golden Gate Cloning adalah alternatif modern yang menggunakan enzim berbeda untuk mencapai ligasi yang mulus."

Formula: Sisipkan Massa = (Massa Vektor × [Masukkan Ukuran / Ukuran Vektor]) × Rasio

Used with this

Similar tools that might be useful

Hektar Per Jam

Hitung kecepatan kerja lapangan dan kapasitas peralatan pertanian.

Frekuensi Alel

Hitung frekuensi alel dan genotipe dalam suatu populasi menggunakan model keseimbangan Hardy-Weinberg.

Kalkulator Kehamilan Alpaca

Perkirakan tanggal lahir (tanggal lahir) alpaka Anda dan lacak kemajuan kehamilan.